全县拥有各类草原2677.55万亩，规模种植牧草达13万亩，主要养殖品种为高山细毛羊、牦牛、马鹿，饲养各类牲畜138.88万头（只），其中自主培育的甘肃高山细毛羊饲养量达43.85万只，年出栏各类牲畜65万多头（只），年产绒毛2000多吨、肉类1.24万吨、鲜奶5700吨，畜牧业收入约占农牧民收入的65％以上，是甘肃省牛羊产业大县和全省优质高山细毛羊基地。甘肃高山细毛羊、肃南牦牛等“三品一标”农产品（产地）认证达21个，“肃南马鹿”和“草原惠成”“回纥牧场”3家企业商标入选“甘味”品牌。

全县共有耕地41.36万亩，拥有各类农机1.5万台（套），农作物耕播收综合机械化水平达到71％。